СыктГУ зарегистрирован администрацией МО «Город Сыктывкар» 15.12.1997, свидетельство № 312/97.

Предыдущие наименования ВУЗа: Сыктывкарский государственный университет имени 50-летия СССР стал именоваться Сыктывкарским государственным университетом на основании Постановления Правительства Российской Федерации от 26 июня 1993 года №593 утвердившем «Типовое положение о ВУЗе», где в п. 13 указывается, что государственные награды бывшего СССР в официальном наименовании высшего учебного заведения не указываются. 

Сыктывкарский государственный университет был переименован в государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Сыктывкарский государственный университет» (ГОУВПО «СыктГУ») на основании приказа № 145-ОСД от 24 июня 2002 года. 

На основании приказов № 278-ОСД, 280-ОСД от 14 июня 2011 года государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Сыктывкарский государственный университет» переименовано в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Сыктывкарский государственный университет» (ФГБОУ ВПО «СыктГУ»). 

В первый учебный год в составе университета были открыты два факультета: историко-филологический и естественных наук, на девяти кафедрах работало более 40 преподавателей. Основными поставщиками кадров стали Коми филиал АН СССР (ныне Коми научный центр УрО РАН), Ленинградский (Санкт-Петербургский), Московский, Пермский государственные университеты и Коми государственный педагогический институт, причем более 1/3 преподавателей были командированы из ЛГУ. В 1972 было принято 350 студентов по 8 специальностям (математика, физика, химия, биология, история, русский язык и литература, коми язык и литература, планирование промышленности).

Первым ректором была назначена известный ученый в области экономики Севера, доктор географических наук, профессор Валентина Александровна Витязева (1919-2010). Она возглавляла вуз в течение 15 лет и являлась в те годы единственной женщиной-ректором университета в СССР. В 1987 году ректором стал доктор физико-математических наук, профессор Алексей Елисеевич  Грищенко (1937-2011), в 1990 году избран на эту должность доктор физико-математических наук, профессор Сергей Иванович Худяев (1934-2004). В 1995-2012 годы университетом руководил доктор экономических наук, профессор Василий Никифорович Задорожный. С 6 ноября 2012 года и.о. ректора, а с 20 февраля 2013 года ректором является является кандидат юридических наук Марина Дмитриевна Истиховская.

В 1973 году с целью улучшения управления учебным процессом факультет естественных наук был разделен на три: физико-математический, химико-биологический и экономический, а в 1977 году историко-филологический - на два: филологический и исторический факультеты. К 1982 году на 5 факультетах обучалось уже 2736 студентов.

В следующем десятилетии конкретные задачи Сыктывкарского университета были определены постановлениями Госкомитета РСФСР по делам науки и высшей школы № 19 от 20 марта 1991 года «О мерах по развитию Сыктывкарского университета» и Совета Министров Коми АССР № 276 от 15 июля 1991 года «О мерах по развитию высшего образования в Коми АССР».

В 2000 году открыта магистратура, организован колледж экономики и права с двумя специальностями среднего профессионального образования, открыт филиал университета в Воркуте с четырьмя специальностями.

В последние годы в университете с учетом потребностей Республики Коми созданы новые специальности, направления подготовки и специализации. Следует отметить большую работу университета в этом направлении. Так, в 2004-2009 годы были открыты 23 образовательные программы высшего профессионального образования, две программы среднего профессионального образования и одна программа начального профессионального образования.

За время своего существования с 1972 года университет выпустил около 30 тысяч специалистов, большинство из которых в настоящее время работает в регионе. 

Начиная с 1994 года, университет успешно проходил процедуры аттестации и государственной аккредитации и процедуру комплексной оценки деятельности. На основании протокола  Аккредитационной коллегии Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки от 16 июля 2009 года № 6-2009/К, утвержденного приказом Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки от 17 июля 2009 года № 1755 ГОУ ВПО «Сыктывкарский государственный университет» признан аккредитованным по 39 основным образовательным программам (высшего профессионального образования - 33, среднего профессионального образования – 6), а также программам дополнительного профессионального образования по профилю основных образовательных программ вуза.

На основании приказа Министерства образования и науки Российской Федерации от 13 апреля 2011 года № 1484 «О переименовании государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Сыктывкарский государственный университет» ГОУ ВПО "СыктГУ" переименован в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Сыктывкарский государственный университет» (ФГБОУ ВПО "СыктГУ").

В Сыктывкарском государственном университете (по данным форм государственной статистической отчетности на 1 октября 2011 года) обучаются по программам высшего профессионального образования 7176 студентов, в том числе 4798 студентов - по дневной форме обучения (70%); 1890 студентов - по заочной форме (28%). По программам среднего профессионального образования по данным форм государственной статистической отчетности СПО-1 на 1 октября 2011 года в университете обучается 388 студентов. Если в 1972 году в структуре вуза было всего 2 факультета и 8 специальностей подготовки, то университет сегодня – это комплекс, в состав которого входят 9 институтов и факультетов, 39 кафедр, колледж. Представлены все уровни образования. Университет имеет лицензию на реализацию:

• 1 программы профессиональной подготовки;
• 1 программы начального профессионального образования;
• 6 специальностей среднего профессионального образования;
• 57 программ (специальностей и направлений подготовки) высшего  профессионального  образования (в том числе 8 - магистерских  программ);
• 33 специальностей послевузовского образования (аспирантура);
• 7 программ дополнительного профессионального образования, в том числе программы, позволяющие студенту получить дополнительную квалификацию: «Преподаватель высшей школы», «Преподаватель», «Менеджер по развитию персонала», «Специалист по стандартизации и сертификации», Экономист по международной системе бухгалтерского учета, финансового менеджмента и аудита", «Переводчик в сфере профессиональной коммуникации». По профилю основных образовательных программ вуз осуществляется более 50 дополнительных образовательных программ.

В университете созданы условия для досуга студентов, культурно-массовой и спортивной работы: четыре спортивных зала, три тренажерных зала, бассейн, Центр художественного творчества с 22 студиями, Музей истории просвещения Коми края и т.д.

В СыктГУ работают следующие подсистемы интегрированной автоматизированной информационной системы управления университетом АСУ-СыктГУ, в том числе разработанных в университете: «Зарплата», «Комплексная бухгалтерия», 1С: Предприятие 7.7 (Материальный учет), АСУ «Стипендия», АСУ «Контингент-Сессия», «Абитуриент», АСУ «Кадры», АСУ «Штаты», «Учебный план».

С 2007 года работа приемной компании автоматизирована с использованием новой системы «Абитуриент» (разработчики – В.Ю.Уваров, В.В.Миронов, Л.С.Носов), которая позволяет формировать разнопрофильные отчеты для приемной комиссии: Расписки, Экзаменационные листы, Рейтинги, Протоколы, Приказы о зачислении и т.п. Новая система интегрируема с системой АСУ «Контингент-Сессия». АСУ «Контингент-Сессия» написана на языке программирования FoxPro 2.6 для MS DOS. Система «Абитуриент» разработана в системе Delphi 2007.

АСУ-СыктГУ функционирует в корпоративной сети университета, подразделения управления университетом оснащены современной вычислительной техникой. На данный момент идет обновление АСУ – подключаются и настраиваются модули системы «GS - Ведомости».

На 1 ноября 2011 года в вузе работает 1068 человек (с учетом совместителей), в том числе профессорско-преподавательский состав – 444 человека (с учетом совместителей – 137 человек), инженерно-технический персонал – 21 человек, административно-хозяйственный – 219 человек, учебно-вспомогательный – 88 человек, обслуживающий персонал – 256 человек.

В СыктГУ проводятся фундаментальные и прикладные научные исследования по гуманитарным, естественным, техническим направлениям. На базе университета организуются международные и всероссийские научные конференции преподавателей и студентов. В университете в разные годы работали и продолжают работать известные ученые, создатели научных школ, доктора наук, профессора: В. Ф. Демьянов, В. Н. Малоземов, Н. А. Фролов, Е. И. Михайловский, В. Л. Никитенков, А. Б. Певный, А. В. Жубр, А. Н. Тихомиров, Н. П. Юшкин, П.А. Колмаков, Л. Н. Котов, В. Л. Бианки, Б. Я. Брач, Л. И. Иржак, В. В. Нагаев, В. И. Лыткин, А. К. Микушев, А. И. Туркин, Е. А. Игушев, В. А. Латышева, В. В. Пахорукова, Т. Я. Гринфельд, А. В. Власов, В. П. Золотарев, Ю. Д. Марголис, Л. П. Рощевская, Э. А. Савельева, В. А. Семенов, Н. А. Архипов, М. Л. Портянко, Л. Д. Широкорад и др.